3.2. Snoede spoler dannes når to eller flere α-spiraler samler sig selv ved at sno sig rundt om hinanden for at danne en venstrehåndet superspole (fig. 3.1C). Selvom dimerer, trimere og tetramerer er de mest almindelige strukturer, kan større coiled-coils på op til syv helixer nu designes forskriftsmæssigt [8].
Hvor findes coiled-coils?
Snoede spiraler findes i proteiner i alle tre livets riger. Coiled-coil-domæner af nogle proteiner er næsten invariable i sekvens og længde, hvilket afslører en strukturel og funktionel rolle for aminosyrer langs hele længden af coiled-coilen.
Hvordan holdes coiled-coils sammen?
En oprullet spole eller superhelix dannes ved at spoles to, tre eller fire α-spiraler sammen. De spiralformede strenge holdes sammen af den hydrofobe kraft, der dannes mellem upolære sidekæder fra de forskellige peptidstrenge.
Hvad er en oprullet spolestruktur?
Oprullede spoler er α-spiralformede strukturer, hvori spiraler er viklet rundt om hinanden for at danne superspiralformede bundter. De består norm alt af to eller tre helixer i parallel eller antiparallel orientering, men strukturer med syv eller flere helixer er blevet bestemt.
Er der forskel på Helix og spole?
Helix er en sekundær struktur og coiled coil er supersekundær struktur, men begge er resultatet af interaktive kræfter mellem de tilstødende aminosyrerester omkring en peptidbinding.
