BLAST er en computeralgoritme, der er tilgængelig til brug online på webstedet National Center for Biotechnology Information (NCBI) såvel som mange andre websteder. BLAST kan hurtigt justere og sammenligne en forespørgsels-DNA-sekvens med en database med sekvenser, hvilket gør den til et kritisk værktøj i løbende genomisk forskning.
Er BLAST en primær database?
BLAST er den mest udbredte software inden for bioinformatikforskning. Dens hovedfunktion er at sammenligne en sekvens af interesse, forespørgselssekvensen, med sekvenser i en stor database BLAST rapporterer derefter de bedste matches, eller "hits", fundet i databasen. Dette enkle program har to primære applikationer.
Er NCBI en database?
NCBI huser en række databaser, der er relevante for bioteknologi og biomedicin og er en vigtig ressource for bioinformatiske værktøjer og tjenester. Større databaser omfatter GenBank for DNA-sekvenser og PubMed, en bibliografisk database for biomedicinsk litteratur. Andre databaser omfatter NCBI Epigenomics-databasen.
Er BLAST kun ansat i NCBI-databaser?
BLAST er tilgængelig på nettet på NCBI-webstedet. Forskellige typer BLAST'er er tilgængelige i henhold til forespørgselssekvenserne og måldatabaserne.
Hvordan fungerer BLAST-databasen?
Hvordan virker BLAST? BLAST identificerer homologe sekvenser ved hjælp af en heuristisk metode, som indledningsvis finder korte overensstemmelser mellem to sekvenser; således tager metoden ikke hele sekvensrummet i betragtning. Efter den indledende kamp forsøger BLAST at starte lokale justeringer fra disse indledende kampe.
